/Поглед.инфо/ Коронавирусите се свързват с клетките, използвайки протеини, които покриват вирусната частица и образуват самата „корона“. Тези протеини изглеждат като издатини с формата на бухалки и се наричат S-протеини (от думата spike , тоест изпъкналост, шип). В новия коронавирус SARS-CoV-2 неговият S-протеин се свързва с клетъчния ензим ACE2, който седи на клетъчната мембрана. В момента вече е известно къде S-протеинът се свързва с ACE2, а коронавирусът дори се опитва по някакъв начин да отвлече вниманието от клетъчния протеин, използвайки молекули-капани.
Но би било най-добре, ако самият имунитет навреме научи за коронавируса и започне да го унищожава. За това са необходими антитела, които ще се свържат с вирусния протеин, като му пречат да работи и в същото време да сигнализират на имунните клетки, че трябва да го изядат незабавно. Изглежда очевидно, че имунната система трябва да се научи как да прави антитела срещу протеина на “короната”. А ако самият имунитет се колебае по този въпрос, трябва да му се помогне с ваксина. Както знаете, ваксината е или наполовина убит патоген, или някаква молекула от него, или парче от молекула, чрез което патогенът може да бъде разпознат: когато ваксинираме, показваме на имунната система парче от молекулата на патогена, точно както на полицейското куче се дава да мирише нещо с миризмата на престъпника - т.е. така имунитетът разбира какво трябва да търси.
И тук възниква проблемът с коронавируса: неговите "корона" протеини са покрити с малки въглехидратни молекули - гликани. Те покриват S-протеините, така че антителата да не могат да се свържат с тях (а в гликановите въглехидрати има твърде малко специфична молекулна информация, за да може да разпознае вируса от тях). Но може би има пропуски в маскировката с въглехидрати?
Сега има методи за молекулен анализ, които позволяват да се разгради протеинова молекула на фрагменти, след което да определите точно кои аминокиселини са гликаните. Това е работата, която са извършили изследователи от университета в Саутхемптън - в статия, публикувана на уебсайта на bioRxiv, те описват структурата на S-протеина на новия коронавирус, като вземат предвид въглехидратните остатъци, които се намират върху него.
В действителност във въглехидратната маскировка на SARS-CoV-2 има явни пропуски - по това той е различен, например, от ХИВ, чиито повърхностни белтъци са покрити с непроницаем въглероден плащ. Но ХИВ действа различно - остава за дълго в организма и се нуждае от надеждна защита. Действията на SARS-CoV-2 са различни по начало, за него е важно да не го забележат за известно време, а след това новите вирусни частици да полетят през въздуха на новия гостоприемник.
Факт е, че в “коронния” протеин SARS-CoV-2, има незащитени, открити места, с които можем да го направим видим за имунната система. Може тези участъци от S-белтъка да се използват за ваксини или може да се конструират лабораторни антитела, които да се свързват с оголените участъци от белтъчната молекула, не ѝ позволявайки да си взаимодейства с клетката. Между другото, точно върху такива инженерни антитела вече работят на места. Има още една статия в bioRxiv, в която служители на Тексаския университет в Остин, Фламандския биотехнологичен институт и други изследователски центрове в САЩ и Германия описват антитела, събрани от парчета човешки и лама имуноглобулини. Ламите са инжектирани с коронавирусен протеин, срещу който се появиха антитела, те са комбинирани с фрагмент от човешки антитела и такава хибридна молекула ефективно неутрализира SARS-CoV-2 при експерименти върху клетъчни култури - антителата не позволяват на вируса да навлезе в клетките.
Вярно е, че според портала The Scientist някои експерти изтъкват, че готовите антитела като метод за лечение могат да бъдат опасни. Например, в експерименти с маймуни, заразени със SARS-CoV (които предизвикаха огнище на SARS през 2002-2003 г.), терапевтичните антитела срещу вируса предизвикаха толкова силен имунен отговор, че не се проведе лечение: в белите дробове се появи същото тежко възпаление като и с нелекуван вирус. Тоест, колкото и да се нуждаем от лекарство срещу новия коронавирус, имунологичните методи на лечение (и не само имунологични) трябва да преминат първо проверка за безопасност.
Превод: В. Сергеев